Tesis doctoral de Amelie Stein
Interacciones mediatos por péptidos en estructuras tridimensionales de alta resolución los procesos moleculares subyacentes a la mayoría de funciones biológicas implican la participación directa de una infinidad de proteínas y múltiples interacciones entre ellas. En esta tesis estudiamos un tipo particular de estas interacciones, de carácter transitorio y altamente específicas, dónde un dominio globular en una proteína reconoce un corto péptido lineal en otra (dmis). En concreto, identificamos múltiples casos de dmis en estructuras tridimensionales (3d) de alta resolución y analizamos las bases moleculares de su especificidad. Además, derivamos parámetros estructurales globales que nos permiten identificar nuevos casos de dmis. Así mismo, y como caso práctico, combinamos el motivo de fosforilación propio de la quinasa humana aurora a con diversas clases de información contextual para predecir y validar 90 nuevos substratos. Por último, incorporamos las caracterizadas dmis en nuestra base de datos de interacciones en 3d (3did) con el fin de diseminar nuestros resultados entre la comunidad científica.
Datos académicos de la tesis doctoral «Peptide-mediated interactions in high-resolution 3-dimensional structures«
- Título de la tesis: Peptide-mediated interactions in high-resolution 3-dimensional structures
- Autor: Amelie Stein
- Universidad: Pompeu fabra
- Fecha de lectura de la tesis: 11/06/2010
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Patrick Aloy Calaf
- Tribunal
- Presidente del tribunal: ferran Sanz carreras
- manuela Helmer-citterich (vocal)
- xavier Salvatella giralt (vocal)
- richard Edwards (vocal)