Theoretical characterization of pentacovalent oxyphosphorane intermediate structures of the hydrolysis of rna catalyzed by rnase a

Tesis doctoral de Elena Formoso Estensoro

En el presente proyecto hacemos uso de métodos teóricos para el análisis y caracterización de los mecanismos de reacción de hidrólisis del enlace fosfodiester en moléculas de arn, y así mismo, el análisis del proceso catalítico llevado a cabo por la enzima rnasa a. utilizando bien métodos clásicos o métodos híbridos qm/mm caracterizamos las estructuras intermedias formadas en la reacción de hidrólisis del arn catalizada por la rnasa a, los oxifosforanos pentacovalentes. Analizamos el estado de protonación de estos intermedios, y como varían sus interacciones con el entorno y el disolvente dependiendo de la protonación. además tomando varias coordenadas de reacción, analizamos diferentes perfiles energéticos de este proceso catalítico y analizamos diferentes mecanismos propuestos en la formación de los intermedios oxifosforanos pentacovalentes.

 

Datos académicos de la tesis doctoral «Theoretical characterization of pentacovalent oxyphosphorane intermediate structures of the hydrolysis of rna catalyzed by rnase a«

  • Título de la tesis:  Theoretical characterization of pentacovalent oxyphosphorane intermediate structures of the hydrolysis of rna catalyzed by rnase a
  • Autor:  Elena Formoso Estensoro
  • Universidad:  País vasco/euskal herriko unibertsitatea
  • Fecha de lectura de la tesis:  25/06/2010

 

Dirección y tribunal

  • Director de la tesis
    • José Javier Lopez Pestaña
  • Tribunal
    • Presidente del tribunal: darrin m. York
    • elixabete Rezabal astigarraga (vocal)
    • annik Dejaegere (vocal)
    • rita Guedes (vocal)

 

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