Identificación de nuevas formas recombinantes circulantes del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 mediante análisis de secuencias completas del genoma vírico

Tesis doctoral de Miguel Thomson Okatsu

Se describen dos nuevas formas recombinantes circulantes (crfs) del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 (vih-1), la crf12-bf y la crf14-bg, identificadas, respectivamente, en argentina y galicia, analizadas mediante amplificación del genoma completo. además de las formas circulantes se analizan los genomas completos de recombinantes únicos relacionados con dichas crfs y, en galicia, de virus de subtipo g no recombinantes. en argentina, se describe por primera vez una alta preValencia de recombinantes bf. Se analizaron secuencias completas de 8 virus recombinantes, directamente amplificadas de adn proviral de células mononucleares de sangre periférica. se observaron 6 ptrones de recombinación diferente. Dos puntos de recombinación eran idénticos en los 8 virus y otros 7 puntos de recombinación consenso, y sólo esos 9, estaban presentes en dos virus, que representan una nueva forma recombinante circulante (crf12-bf). Los árboles filogenéticos y los análisis de aminoácidos y nucleótidos característicos apoyan el origen común de los recombinantes bf de argentina y la relación filogenética de los segmentos de subtipo f con virus de subtipo f de brasil. Las distancias genéticas y las fechas de infección sugieren que la crf12-bf es la más antigua de las crfs de vih-1 de origen no africano. En vista de la no detección de virus de subtipo f no recombinantes en argentina, se emite la hipótesis de un posible origen brasileño de la crf12-bf. en galicia, se describe la circulación de cepas de vih-1 recombinantes bg y de subtipo g no recombinante en una minoría de usuarios de drogas inyectables. Se analizan secuencias del genoma completo de 9 virus, 7 recombinantes bg y 2 subtipo g no recombinante, amplificadas directamente de arn del plasma. Seis de los recombinantes bg presentan una estructura en mosaico idéntica, con dos únicos puntos de recombinación que delimitan un segmento de subtipo b que comprende la

 

Datos académicos de la tesis doctoral «Identificación de nuevas formas recombinantes circulantes del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 mediante análisis de secuencias completas del genoma vírico«

  • Título de la tesis:  Identificación de nuevas formas recombinantes circulantes del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 mediante análisis de secuencias completas del genoma vírico
  • Autor:  Miguel Thomson Okatsu
  • Universidad:  Autónoma de Madrid
  • Fecha de lectura de la tesis:  29/10/2002

 

Dirección y tribunal

  • Director de la tesis
    • Rafael Najera Morrondo
  • Tribunal
    • Presidente del tribunal: esteban Domingo solans
    • joaquín Dopazo blázquez (vocal)
    • cecilio López galíndez (vocal)
    • m. angeles Muñoz fernandez (vocal)

 

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