Estudio de la estructura tridimensional y de la dinámica de oligosacaridos modelos de glicosaminoglicanos mediante rmn y simulaciones de dinámica molecular

Tesis doctoral de Jesús Angulo álvarez

En esta tesis doctoral se presentan los estudios estructurales de oligosacáridos modelos de glicosaminoglicanos (gags) que se han sintetizado para abordar el estudio de las bases moleculares de la activación de los factores de crecimiento para fibroplastos (fgfs). Se han resuelto las estructuras tridimensionales de 4 hexasacáridos con diferentes patrones de sulfatación mediante espectroscopía de rmn y modelización molecular. Mediante la detección de señales de efecto overhauser nuclear (noe), y las predicciones teóricas de la mecánica molecular, se ha podido determinar una estructura global en términos de una hélice a derechas a nivel del esqueleto covalente oligosacarídico, similar para los 4 hexasacáridos y análoga a la descrita paral a heparina natural. El análisis de constantes de acoplamiento vecinales homonucleares ha evidenciado un equilibrio de confórmeros para los anillos de ácido idurónico constituyentes. los datos de relajación homo- y heteronuclear han puesto de manifiesto una orientación hidrodiámica anisotrópica de estos productos en disolución, así como una marcada rigidez de dicha conformación helicoidal. Para el estudio dinámico de estas moléculas se ha realizado una investigación metodológica de distintas condiciones de simulación de dinámica molecular. Para el acuerdo con los datos de rmn ha sido necesaria la aplicación del ametodología partícula. malla de ewald en dichas simulaciones. Esta metodología ha permitido la obtención de dinámicas moleculares en las que los confórmeros del anillo de idurónico son estables, revelando la importancia del tratamiento electrostático adecuado para estos sistemas moleculares con una elevada carga negativa.

 

Datos académicos de la tesis doctoral «Estudio de la estructura tridimensional y de la dinámica de oligosacaridos modelos de glicosaminoglicanos mediante rmn y simulaciones de dinámica molecular«

  • Título de la tesis:  Estudio de la estructura tridimensional y de la dinámica de oligosacaridos modelos de glicosaminoglicanos mediante rmn y simulaciones de dinámica molecular
  • Autor:  Jesús Angulo álvarez
  • Universidad:  Sevilla
  • Fecha de lectura de la tesis:  19/12/2002

 

Dirección y tribunal

  • Director de la tesis
    • Pedro Manuel Nieto Mesa
  • Tribunal
    • Presidente del tribunal: Mendoza sanz Javierde
    • José Fuentes mota (vocal)
    • Manuel Rico sorompas (vocal)
    • Jesús Jiménez-barbero (vocal)

 

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