Análisis genómico del catabolismo de compuestos aromáticos en pseudomonas putida kt2440: caracterización molecular de la ruta de degradación del ácido nicotínico

Tesis doctoral de Jiménez Zarco José Ignacio

La cepa pseudomonas putida kt2440 es un microorganismo modelo para procesos relacionados con la biodegradación de contaminantes en el medio ambiente, además de otras aplicaciones biotecnológicas. En esta tesis se ha realizado un estudio detallado de los genes implicados en las rutas de degradación de compuestos aromáticos presentes en el genoma de la cepa kt2440 que permitió determinar el potencial catabólico global de la bacteria frente a este tipo de compuestos. En ese sentido, se identificaron cinco rutas centrales de degradación, correspondientes a los metabolitos protocatecuato (genes pca), catecol (genes cat), fenilacetato (genes pha), homogentisato (genes hmg) y galato (genes gal). Además, se identificaron los genes que codifican las rutas periféricas de degradación de p-hidroxibenzoato, benzoato, compuestos fenilpropenopides, quinato, feniletilamina, fenilalcanoatos, fenilacetaldehído, fenilalanina y tirosina. un resultado adicional del análisis fue la identificación de una nueva ruta de degradación del ácido nicotínico (genes nic), un compuesto aromático n-heterociclo, que en su degradación genera metabolitos con elevada actividad biológica empleados en la síntesis de fármacos. la caracterización molecular de los genes nic permitió la identificación de nuevas enzimas que participan en su mineralización. En una primera etapa participa una nicotinato hidroxilasa (nicab), una hidroxilasa dependiente de molibdeno que no había sido caracterizada previamente, y que transforma el ácidonicotínico en ácido 6-hidroxinicotínico que es empleado en la síntesis de insecticidas. en una segunda etapa, una 6-hidroxinicotinato hidroxilasa (nicc) transforma el ácido 6-hidroxinicotínico en el intermediario central 2,5-dihidroxipiridina, que es empleado en la síntesis del ácido aminolevulínico precursor de la síntesis de compuestos antitumorales. La 2,5-dihidroxipiridina sufre la pérdida de aromaticidad por la acción de nicx, que co

 

Datos académicos de la tesis doctoral «Análisis genómico del catabolismo de compuestos aromáticos en pseudomonas putida kt2440: caracterización molecular de la ruta de degradación del ácido nicotínico«

  • Título de la tesis:  Análisis genómico del catabolismo de compuestos aromáticos en pseudomonas putida kt2440: caracterización molecular de la ruta de degradación del ácido nicotínico
  • Autor:  Jiménez Zarco José Ignacio
  • Universidad:  Complutense de Madrid
  • Fecha de lectura de la tesis:  30/06/2006

 

Dirección y tribunal

  • Director de la tesis
    • José Luis Garcia Lopez
  • Tribunal
    • Presidente del tribunal: julian Perera gonzalez
    • victor De lorenzo prieto (vocal)
    • eduardo Sanero santurino (vocal)
    • Fernando Rojo de castro (vocal)

 

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