Tesis doctoral de Marc Vilaplana Polo
Esta tesis es una continuación de los estudios iniciados por el equipo en el campo de las relaciones estructura-actividad (sar y qsar) de los brasinoesteroides (brs) mediante métodos computacionales. El objetivo general es centrar la atención en la cadena lateral, ya que la influencia de los hidroxilos dependía del tipo de estudio (cuantitativo o cualitativo) y la influencia del extremo final de la cadena lateral er muy genérica. El desarrollo de este objetivo principal ha llevado a: 1. Estudiar las cadenas laterales de los análogos brs androstánicos: basándose en la aproximación al análogo activo tomando como referente la estructura de la brasinolida, se ha observado que los análogos ?-Hidroxiester i ?-Aminoester son computacionalmente buenos candidatos para presentar actividad brassinoesteroide. Una vez sintetizados (en una tesis paralela), tres análogos con la funcionalidad libre han resultado inactivos mientras que cuatro análogos con la funcionalidad protegida han resultado activos o moderadamente activos. Basándose nuevamente en la aaa, no ha sido posible explicar computacionalmente y de forma inequívoca la actividad o inactividad de estos análogos. 2. Revisar y redefinir la conformación activa de los brs: se ha llegado a la conclusión que la conformación activa in silicio es la llamada hip. Esta es la que explica con más coherencia la distribución tridimensional tanto de los hidroxilos como del extremo final de la cadena lateral a fin de explicar la unión de las cinco cadenas laterales tipo de los brs con el receptor. La razón por la cual se han encontrado diversas conformaciones activas se encuentra en el análisis conformacional y no en los procesos de selección de la conformación activa. 3. Estudiar la influencia de la conformación activa de los brs en los modelos de qsar: conformaciones activas estructuralmente diferentes han dado lugar a modelos cuantitativamente similares, pero cualitativamente diferentes. Cuantitativamente similares porque las partes de los brs que correlacionan con la actividad son las mismas. Cualitativamente diferentes porque la contribución a la actividad de dichas partes, especialmente de la cadena lateral, y la variación de la predictibilidad en función de la estructura son diferentes en cada caso. los modelos reducidos y el modelo homo han puesto de manifiesto que no se puede extraer más información de los modelos debido a los desequilibrios estructurales del conjunto de brs que conforman el «data set». el modelo a 1 ?G/planta explica los requisitos estructurales que hacen que un br sea activo o inactivo. El modelo hip explica los requisitos estructurales que determinan el grado de actividad de los brs activos. fuera del objetivo principal, pero íntimamente relacionado con los estudios de qsar se ha querido: 4. Determinar el error experimental de la respuesta y de los datos de actividad: comparándolos con los errores de los modelos, se observa que el modelo a 1 ?G/planta está bastante bien ajustado y tiene poco margen de mejora. En cambio, el modelo hip puede mejorar considerablemente sobretodo en la predictibilidad, siempre y cuando se solucionen los desequilibrios estructurales. por otro lado, se ha observado que los diferentes tratamientos estadísticos realizados en el bioensayo no afectan significativamente al valor de actividad.
Datos académicos de la tesis doctoral «El paper de la cadena lateral en les relacions estructura activitat dels brassinoestereoide«
- Título de la tesis: El paper de la cadena lateral en les relacions estructura activitat dels brassinoestereoide
- Autor: Marc Vilaplana Polo
- Universidad: Ramón llull
- Fecha de lectura de la tesis: 13/03/2008
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Carme Brosa Ballesteros
- Tribunal
- Presidente del tribunal: Antonio Planas sauter
- jordi Bujons vilas (vocal)
- magdalena Faijes simona (vocal)
- ismael Zamora rico (vocal)