Tesis doctoral de Javier Botet Rodriguez
El trabajo recogido en la memoria de tesis, se enmarca dentro de un proyecto más amplio de acción estratégica en genómica y proteómica, denominado «levas3», en el que ha participado un consorcio de laboratorios españoles. este proyecto multidisplinar ha tenido como objetivo el análisis global de las repuestas a estrés celular en la levadura saccharomyces cerevisiae, empleando para ello diversas aproximaciones «ómicas», que incluyen: el análisis del transcriptoma, el análisis del proteoma, y el análisis de los fenotipos, siendo este último el objeto de este trabajo. el objetivo de este trabajo de tesis ha sido la identificación de los procesos celulares involucrados en la respuesta al estrés celular provocado por dieciséis compuestos que inducen estrés a distintos niveles en la célula (estrés genotoxico, estrés metabólico, estrés oxidativo, estrés sobre la pared celular, inhibidores de la traducción), la caracterización funcional de los genes involucrados en los mecanismos de sensibilidad/resistencia frente a estos compuestos, y la determinación del mecanismo de acción de los mismos. La aproximación empleada ha consistido en realizar un análisis fenotípico cuantitativo de la respuesta a estrés celular ejercido por dichos compuestos en la colección completa de mutantes de deleción de la levadura saccharomyces cerevisiae, generando así perfiles químico-genómicos de sensibilidad y resistencia de cada uno de los agentes empleados. en la memoria se presentan en detalle tres bloque de resultados, correspondientes a distintos escrutinios: el primer bloque correspondiente al escrutinio realizado con el antifolato sulfanilamida. En este escrutinio hemos identificado y caracterizado al orf ymr289w como abz2, una 4-amino-4-deoxicorismato liasa, responsable del último paso en la biosíntesis de paba en la levadura. el segundo bloque dedicado al escrutinio con el antifúngico sordarina. Entre otros procesos, hemos identificado a la ruta de síntesis de diftamida como necesaria para que la sordarina ejerza su función, y además hemos caracterizado la importancia biológica de esta compleja modificación post-traduccional de eef2. estos dos primeros bloques constituyen un claro ejemplo de la utilidad de los escrutinios químico-genómicos con colecciones de mutantes para la identificación y caracterización funcional de orfs de función desconocida. por último, un bloque de resultados correspondiente a los ensayos realizados con los agentes genotóxicos ácido micofenólico y 4-nqo, en el que hemos identificado nuevos factores implicados en la elongación de la transcripción y en la reparación de dna acoplada al proceso de transcripción (tc-ner). El estudio ha revelado nuevas funciones en este proceso de genes previamente implicados en la transcripción, como son los complejos paf y ccr4-not, evidenciando la relación funcional existente entre la reparación de dna y la elongación de la transcripción.
Datos académicos de la tesis doctoral «Perfiles de interacción químico-genómicos en saccharomyces cervisiae: respuesta a agentes estresantes«
- Título de la tesis: Perfiles de interacción químico-genómicos en saccharomyces cervisiae: respuesta a agentes estresantes
- Autor: Javier Botet Rodriguez
- Universidad: Salamanca
- Fecha de lectura de la tesis: 23/10/2009
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- José Luis Revuelta Doval
- Tribunal
- Presidente del tribunal: Francisco Rey iglesias
- Juan Cabello pardos (vocal)
- María del pilar Perez gonzalez (vocal)
- faustino Mollinedo García (vocal)