Tesis doctoral de Giovanni Cincilla
Mi tesis doctoral, titulada «computational tools for chemical space exploration», está enfocada en la dinamización de las fases iniciales del proceso de descubrimiento y desarrollo de fármacos y puede ser dividida en dos proyectos. 1. Desarrollo de un método para estructurar grandes quimiotecas (librerías químicas). El método se funda en: ¿ innovadores descriptores moleculares lineares (lingo) que permiten calcular de manera ultra rápida la similaridad y importantes propiedades químicofísicas de compuestos. ¿ un novedoso algoritmo de clustering (affinity propagation clustering). la estructura del espacio químico analizado, que se obtiene por la aplicación del método desarrollado permite: ¿ un rápido acceso a la información física, química y biológica contenida en la base de datos. ¿ una organización de las moléculas útil para análisis de tipo qspr (quantitative structure-property relationship) y qsar (quantitative structure-activity relationship). 2. Implementación de una nueva función de scoring para el programa de docking molecular autodock 3.0 que proporciona un tratamiento modificado de la solvatación. Las modificaciones introducidas tienen el efecto de mejorar la estimación de la estructura y la energía unión de complejos ligandos-proteinas.
Datos académicos de la tesis doctoral «Computational tools for chemical space exploration«
- Título de la tesis: Computational tools for chemical space exploration
- Autor: Giovanni Cincilla
- Universidad: Barcelona
- Fecha de lectura de la tesis: 23/04/2010
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Miquel Pons Valles
- Tribunal
- Presidente del tribunal: robert Konrat
- xavier Barril alonso (vocal)
- (vocal)
- (vocal)