Tesis doctoral de Raquel Bermudo Gascón
El cáncer de próstata (cp) es la segunda neoplasia más frecuente en hombres a nivel mundial, por lo que representa una enfermedad de gran impacto social, sanitario y económico. Su elevada heterogeneidad clínica e histológica dificulta su estudio y es la causa de que muchos aspectos de esta enfermedad sean todavía desconocidos. Su diagnóstico precoz se basa en la detección en sangre de los niveles del antígeno específico de próstata (psa), sin embargo, aunque el psa ha supuesto una gran mejora en el diagnóstico, genera demasiados falsos positivos y negativos, debido a que es un marcador tisular, pero no tumoral. Debido a esta baja especificidad, un diagnóstico certero sólo puede conseguirse mediante el estudio histopatológico de tejido de próstata. en este trabajo hemos llevado a cabo un estudio transcriptómico del cáncer de próstata, a partir del cual, mediante un análisis por fada, el cual se basa en el análisis factorial, hemos identificado 318 genes diferencialmente expresados entre tejido benigno y maligno, 184 de los cuales están infraexpresados y 134 sobreexpresados en los tumores de próstata. el análisis in silico de estos resultados nos ha permitido inferir mecanismos moleculares alterados en los tumores. Por un lado, hemos determinado las rutas moleculares más representadas por estos genes (adhesión focal, regulación del citoesqueleto de actina, fosforilación oxidativa y metabolismo de las purinas) y hemos podido predecir la implicación de algunos factores de transcripción en la expresión desregulada de los tumores (nfy, nhlh1, myf, srf). Por último, el estudio de las localizaciones cromosómicas de los 318 genes seleccionados por fada, resaltó la región 17q25.3 como potencialmente ganada en los tumores, lo cual se confirmó posteriormente por hibridación in situ fluorescente en un 65% de los tumores primarios, un 60% de las metástasis y en todas las lesiones de neoplasia intraepitelial prostática (lesión preneoplásica) asociadas a tumor. en un intento de mejorar los actuales métodos diagnósticos del cáncer de próstata, hemos aplicado un análisis discriminante lineal (lda) a los datos obtenidos por los microarrays, con el objetivo de encontrar signaturas de genes capaces de discriminar entre diferentes tipos de muestras. Este abordaje nos ha permitido generar tres modelos. El primero, de 7 genes, discrimina las muestras de tejido de próstata normales y tumorales con un 97,9% (190/194) de acierto, con una sensibilidad del 98.6% y una especificidad del 96.3%. El segundo modelo, formado por 5 genes, discrimina las muestras de pin del resto de muestras (normal y tumoral) con un 100% de acierto. Por último, usando las muestras obtenidas del lavado de las agujas usadas en las biopsias transrectales de próstata, hemos generado un modelo de 6 genes capaz de clasificar correctamente el 92.6% de los pacientes, con un 88.8% de sensibilidad y un 96.1% de especificidad. éste último modelo podría ser de gran utilidad en la práctica clínica, como complemento en el diagnóstico histopatológico de las biopsias de próstata.
Datos académicos de la tesis doctoral «Perfiles transcripcionales del cáncer de próstata / perfils transcripcionals al cÁ ncer de próstata«
- Título de la tesis: Perfiles transcripcionales del cáncer de próstata / perfils transcripcionals al cÁ ncer de próstata
- Autor: Raquel Bermudo Gascón
- Universidad: Barcelona
- Fecha de lectura de la tesis: 26/03/2010
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Timothy Thomson Okatsu
- Tribunal
- Presidente del tribunal: Antonio López beltrán
- rosanna Paciucci barzanti (vocal)
- (vocal)
- (vocal)