Tesis doctoral de David Piedra García
La presente tesis doctoral se ubica en el campo de la predicción estructural de proteínas, y el consecuente análisis de elementos funcionales. Más concretamente los estudios se pueden dividir en dos bloques: análisis y mejora de predicciones estructurales de novo, y estudio del comportamiento de las cavidades en mulantes y modelos por homología. en el primer bloque se han abordado tres puntos. El primero trata la identificación de la familia estructural de un conjunto de predicciones de novo usando herramientas de comparación estructural y sistemas de predicción basados en inteligencia artificial. El segundo trata sobre la caracterización de aquellas zonas en las predicciones que gozan de una mayor calidad. En el último punto de este bloque se usa la información obtenida en los dos puntos anteriores con el objetivo de mejorar la calidad inicial de las predicciones de novo utilizadas. el segundo bloque, tal y como se ha mencionado, se centra en el estudio de elementos funcionales de las proteínas, más concretamente se tratan las cavidades, dado su importante papel y vinculación con la actividad y función proteica. Se ha estudiado en primer lugar el efecto de las mutaciones puntuales en la geometría y composición de las cavidades de la lisozima humana; en segundo lugar se ha tratado como se degrada el patrón de cavidades en los modelos por homología, a medida que la calidad de estos disminuye.
Datos académicos de la tesis doctoral «Caracterització i millora de models estructurals de baixa resolució«
- Título de la tesis: Caracterització i millora de models estructurals de baixa resolució
- Autor: David Piedra García
- Universidad: Barcelona
- Fecha de lectura de la tesis: 13/01/2009
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Xavier De La Cruz Montserrat
- Tribunal
- Presidente del tribunal: ignacio Fita rodriguez
- susana Kalko witruk (vocal)
- alexandre Sanchez pla (vocal)
- xavier Barril alonso (vocal)