Tesis doctoral de Marc Abella Rusiñol
El sistema sos es una red multigénica controlada negativamente por la proteína lexa, y está formado por un conjunto de genes implicados en el mantenimiento de la viabilidad celular frente a lesiones en el dna. Este sistema se encuentra en la mayoría de especies bacterianas, pese a que existen diferencias tanto en la secuencia de unión de la proteína lexa, como en el contenido genético del regulón. En la presente memoria se describe el sistema sos de pseudomonas putida, una bacteria gram negativa perteneciente al grupo gama. Primeramente se han clonado los dos genes lexa, denominados lexa1 y lexa2, y se han obtenido sus productos génicos mediante sobreexpresión y purificación por columnas de afinidad. Ambas proteínas se han utilizado en ensayos de movilidad electroforética (emsa) con los promotores de cada uno de los genes lexa. Así se ha podido identificar la secuencia de unión de la proteína lexa1 (ctgtn8acag) y de la proteína lexa2 (agtacn4gtgct). Posteriormente, utilizando rt-pcr, se ha visto como el gen lexa2 constituye una única unidad transcripcional con los genes que lo siguen, formando la casete lexa2-imua-imub-dnae2. Esta casete se ha visto que es inducible por daños en el dna, y que se encuentra ampliamente distribuido en el dominio bacteria. Seguidamente, se han obtenido dos cepas mutantes defectivas por los genes lexa1 y lexa2, y se ha analizado la expresión génica de cada una de ellas, respeto la cepa silvestre, utilizando chips de dna (microarrays). Los resultados obtenidos han demostrado que la proteína lexa1 controla la mayoría de genes del sistema sos, que además corresponden con la respuesta convencional de su grupo filogenético; mientras que la proteína lexa2 sólo regula la expresión de su propia unidad transcripcional, y la de un gen (pp3901) perteneciente a un profago residente de p. Putida. Además, este gen también se encuentra controlado por la proteína lexa1, siendo el único que comparte las dos regulaciones. L
Datos académicos de la tesis doctoral «Coexisténcia de dos regulons lexa a pseudomonas putida«
- Título de la tesis: Coexisténcia de dos regulons lexa a pseudomonas putida
- Autor: Marc Abella Rusiñol
- Universidad: Autónoma de barcelona
- Fecha de lectura de la tesis: 11/01/2008
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Jordi Barbé García
- Tribunal
- Presidente del tribunal: Miguel Regué
- Sandra Villegas (vocal)
- Antonio Villaverde (vocal)
- Jordi Vila (vocal)