Tesis doctoral de Néstor Santiago Gonzalvo
El trabajo presentado en esta tesis se centra en el estudio del impacto de los elementos transponibles sobre los genes y genomas vegetales y en los mecanismos de control de la transposición en estos genomas. Para ello se ha analizado, por un lado, la dinámica que ha seguido la familia emigrant de mites dentro del genoma de arabidopsis. Y, por otro lado, se analiza el control de la transcripción del retrotransposón tnt1 de tabaco. 1. Estudio del impacto de los elementos transponibles sobre los genomas vegetales: análisis de la familia emigrant de mites de arabidopsis thaliana. los mites son pequeños transposones de dna sin capacidad codificante, presentes en un elevado número de copias en la mayoría de los genomas. Se postula que son movilizados por elementos autónomos emparentados, presentes en los mismos genomas. El primer grupo de mites descrito en arabidopsis fue la familia emigrant (casacuberta et al., 1998). el objeto de nuestro estudio es conocer la dinámica de estos elementos y su efecto sobre la evolución de los genes y genoma de arabidopsis. se ha diseñado un programa informático para identificar todas las copias de elementos emigrant contenidas en el genoma de arabidopsis. Con tal de encontrar el máximo número de elementos emigrant, se fundamentó la búsqueda en las repeticiones terminales (tirs) conservadas que definen esta familia de mites. De esta forma se pueden encontrar subfamilias representadas por un bajo número de copias o aquellas copias antiguas y, por tanto, más divergentes. también se han desarrollado otras herramientas informáticas que han permitido realizar análisis filogenéticos y evolutivos de estos elementos. A su vez, mediante técnicas moleculares se ha estudiado el polimorfismo de estos mites existente entre diferentes ecotipos de arabidopsis. mediante estos análisis se han identificado 151 copias emigrant distribuidas por todo el genoma de arabidopsis. La mayoría de éstas
Datos académicos de la tesis doctoral «Control de la transposición e impacto de los elementos transponibles en genomas vegetales: análisis del retrotransposón tnt1 de tabaco y del mite emigrant de arabidopsis«
- Título de la tesis: Control de la transposición e impacto de los elementos transponibles en genomas vegetales: análisis del retrotransposón tnt1 de tabaco y del mite emigrant de arabidopsis
- Autor: Néstor Santiago Gonzalvo
- Universidad: Autónoma de barcelona
- Fecha de lectura de la tesis: 10/02/2006
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Josep María Casacuberta Suñer
- Tribunal
- Presidente del tribunal: alfredo Ruiz panadero
- Javier Costas costas (vocal)
- cesar Llave correas (vocal)
- Carlos Vicient sánchez (vocal)