Tesis doctoral de Anna Doménech Gimeno
El objetivo de esta tesis es identificar nuevos genes de importancia relevante en el síndrome de down. La primera aproximación, en la que se implicaron varios miembros del grupo de investigación, fue la construcción de un mapa físico y transcripcional de una 3 mb del cromosoma 21 (hsa21). se llevó a cabo una selección de cdna en la cual se identificó un nuevo gen del hsa21 (no caracterizado en esta tesis). Posteriormente se cambió de estrategia i se llevó a cabo una aproximación in silico en la cual bases de datos de ests se compararon con secuencias genómicas del hsa21. El estudio prosiguió con un est humano. El cdna de 850 pb se asiló de mrna de corazón y contiene una pauta de lectura abierta de 123 aa, y se le llamó kcne2 debido a su similitud con el gen kcne1 (una subunidad de canales de potasio). kcne2 se expresa mayoritariamente en estómago; codifica una proteína n-glicosilada en dos posiciones y se inserta en la membrana celular con su extremo n-terminal dirigido hacia el exterior celular. En dos pacientes con sordera no sindrómica se encontró un cambio de nucleótido a22g que provoca el cambio de aa t8a, que produce la pérdida de un lugar consenso de n-glicosilación. Con el propósito de identificar nuevas subunidades de canales de potasio dependientes de voltaje, se hizo una búsqueda con el programa blast en las bases de datos de ests con las secuencias de kcne1 y kcne2. El estudio continuó con 8 ests la secuencia consenso de los cuales contenía una pauta de lectura abierta de 103 aa. El cdna se asiló de mrna de colon humano i tiene 1646 pb. Este nuevo gen recibió el nombre de kcne3 debido a su similitud con kcne1 y kcne2, y se mapó en 11q13-14. Kcne3 se expresa en colon, intestino delgado, ovario y sangre periférica. Igual que los otros miembros de la familia, la proteína está n-glicosilada y se inserta en la membrana celular con su extremo n-terminal dirigido hacia el medio extrecelular. Se encontró
Datos académicos de la tesis doctoral «Identificació de nous gens a la regió cromosómica 21q22. caracterizació molecular de kcne2 i kcne3«
- Título de la tesis: Identificació de nous gens a la regió cromosómica 21q22. caracterizació molecular de kcne2 i kcne3
- Autor: Anna Doménech Gimeno
- Universidad: Barcelona
- Fecha de lectura de la tesis: 12/12/2001
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Xavier Estivill Pallej?
- Tribunal
- Presidente del tribunal: rosa Miró
- montserrat Mila (vocal)
- bru Cormand (vocal)
- cristina Fillat (vocal)