Tesis doctoral de Claudia Schaffner Barbero
Ftsz es una proteína citoesquelética esencial para la citocinesis bacteriana. Ftsz ensambla formando polímeros que constituyen el anillo z, que dirige división celular en bacterias. Forma parte de la familia de gtpasas de la tubulina, que también inc luye ??-Tubulina, ?-Tubulina, tubulina bacteriana btuba/b y tubz. En presencia de gtp, ftsz autoensambla cooperativamente formando protofilamentos sencillos mientras que en presencia de gdp se produce el desensamblaje. ftsz es una diana atractiva pa ra la búsqueda de pequeñas moléculas inhibidoras que podrían constituir una nueva clase de compuestos antibacterianos para combatir la emergencia continua de resistencia a antibióticos por parte de bacterias patógenas. Caracterizar la unión de nucleó tidos de guanina a ftsz puede aportar información sobre los mecanismos funcionales de la proteína y ser útil para el diseño de nuevos inhibidores específicos de ftsz. Además, un ensayo que permita medir la unión de cualesquiera moléculas al sitio de nucleótido de ftsz podría ser utilizado para buscar inhibidores para la proteína. esta tesis consta de tres secciones principales. En la primera, se ha desarrollado un método de competición, empleando el análogo fluorescente de gtp mant-gtp, que pe rmite la detección y la medición de la afinidad de compuestos que se unen al sitio de nucleótido de ftsz. Además se ha optimizado un método de competición complementario, basado en el desplazamiento de gtp marcado radiactivamente (3h-gtp), para contr astar las afinidades medidas con ambos métodos. en la segunda sección se empleó el método de competición con mant-gtp para estudiar la unión de los ligandos naturales, gtp y gdp, a su sitio en ftsz. Para ello se midieron las uniones de estos ligando s, de sus moléculas componentes (gmp, guanosina, tripirofosfato, pirofosfato y fosfato inorgánico) y de otros nucleótidos (atp, ctp y utp). Además se realizaron simulaciones de dinámica molecular para determinar el tipo y localización de las interacc iones entre los nucleótidos y ftsz. en la tercera sección de la tesis se investigaron los efectos de compuestos con una química diferente al gtp sobre ftsz. En primer lugar se estudiaron una serie de compuestos elegidos a partir de cribaje virtual c omo posibles competidores con gtp por el sitio de unión a nucleótido de ftsz. Por otra parte también se estudió mciz, un péptido antibacteriano con supuestos efectos inhibidores sobre ftsz y un sitio de unión predicho como cercano al de nucleótido. P
Datos académicos de la tesis doctoral «Interacciones de la proteína de división celular ftsz con nucleótidos e inhibidores. en busca de nuevos antibióticos.«
- Título de la tesis: Interacciones de la proteína de división celular ftsz con nucleótidos e inhibidores. en busca de nuevos antibióticos.
- Autor: Claudia Schaffner Barbero
- Universidad: Complutense de Madrid
- Fecha de lectura de la tesis: 02/12/2010
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- José Manuel Andreu Morales
- Tribunal
- Presidente del tribunal: Francisco Montero carnerero
- Miguel angel De pedro montalban (vocal)
- José Fernando Díaz pereira (vocal)
- pablo Chacon montes (vocal)