Tesis doctoral de Ramón Aragués Peleato
La importancia de comprender los procesos biológicos ha estimulado el desarrollo de métodos para la detección de interacciones proteína-proteína. Esta tesis presenta piana (protein interactions and network analysis), un programa informático para la integración y el análisis de redes de interacción proteicas. Además, describimos un método que identifica motivos de interacción basándose en que las proteínas con parejas de interacción comunes tienden a interaccionar con esas parejas a través del mismo motivo de interacción. Encontramos que las proteínas altamente conectadas (i.E., Hubs) con múltiples motivos tienen mayor probabilidad de ser esenciales para la viabilidad de la célula que los hubs con uno o dos motivos. Finalmente, presentamos un método que predice genes relacionados con cáncer mediante la integración de redes de interacción proteicas, datos de expresión diferenciada y propiedades estructurales, funcionales y evolutivas. El valor de predicción positiva es 71% con sensitividad del 1%, superando a otros métodos usados independientemente.
Datos académicos de la tesis doctoral «Protein interaction networks and their applications to protein characterization and cancer genes prediction«
- Título de la tesis: Protein interaction networks and their applications to protein characterization and cancer genes prediction
- Autor: Ramón Aragués Peleato
- Universidad: Pompeu fabra
- Fecha de lectura de la tesis: 13/07/2007
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Baldomero Oliva Miguel
- Tribunal
- Presidente del tribunal: luís Serrano pubull
- robert Castelo valdueza (vocal)
- m. Kim philip (vocal)
- marc antoni Marti renom (vocal)