Survival data analysis with heavy-censoring and long-term survivors

Tesis doctoral de Lucas López Segovia

La investigación desarrollada en esta tesis ha sido motivada por dos conjuntos de datos, introducidos en el capítulo 2, uno relacionado con la mortalidad de terneros desde el nacimiento hasta el destete, el otro con la supervivencia de los pacientes diagnosticados con melanoma. En ambos el porcentaje de censura es alto, la presencia de individuos inmunes es probable y un modelo que tome en cuenta esta proporción no despreciable de individuos inmunes será el más apropiado para su análisis. los modelos de cura combinados se introducen en el capítulo 3 junto con el software disponible para realizar el análisis, tales como sas, r y stata, entre otros. Investigamos el efecto que una alta censura podría tener en la estimación de los coeficientes de regresión en el modelo de cox, vía estudios de simulación para varios escenarios dado por diferentes tamaños de muestra y niveles de censura. Los resultados son presentados en el capítulo 4. La aplicación de un modelo de cura combinado, que incluye un modelo de cox para la parte de supervivencia y un modelo logístico para la parte de cura de los pacientes con melanoma, se describe en el capítulo 5. Se presentan discusiones acerca de la prueba para el seguimiento suficiente y niveles de censura. El análisis se realiza mediante la macro de sas: pspmcm. Los resultados muestran que los pacientes con ganglios linfáticos centinela (sln): con biopsia negativa, nivel de clark de invasión i-iii, subtipo histopatológica de melanoma maligno: con extensión superficial (ssm), menores de 46 años y mujer, tienen más probabilidades de ser curados, mientras que pacientes con melanoma en cabeza o cuello, breslow micrométrico mayor o igual a 4mm de profundidad y ulceración presente, son pacientes con mayor riesgo de recaída. En particular, pacientes con breslow micrométrico mayor o igual 4mm de profundidad están en riesgo de muerte. Por otra parte, como los modelos de cura combinados no tienen la propiedad de riesgos proporcionales para la población, estos pueden ser extendidos a modelos de cura no combinados via modelos de transformación no lineal definidos en tsodikov (2003). Se presenta aplicación de los modelos de riesgo extendido para los datos de mortalidad de terneros en el capítulo 6. la metodología permite obtener estimaciones de la proporción de cura, así como los efectos de los factores genéticos y ambientales para cada rebaño. Una característica relevante de los modelos de cura no combinados es que modelan por separado, los factores que podrían afectar la supervivencia de aquellos que afectan el modelo de cura, y la interpretación es relativamente fácil. Los resultados se muestran en la sección 6.3.1 y se obtuvieron utilizando la librería nltm del paquete estadístico r. Los efectos a corto plazo (mortalidad) y a largo plazo (sobrevivientes) son determinados para cada factor, así como su significación estadística en cada rebaño. Por ejemplo en el rebaño 1, encontramos que el mes del parto y la dificultad al nacer son estadísticamente significativos para la proporción no susceptible (sobrevivientes a largo plazo). Terneros nacidos en el periodo marzo-agosto tienen baja probabilidad de sobrevivir que aquellos nacidos en septiembre y febrero; y la probabilidad de sobrevivir es mucho menor para aquellos que tienen dificultades en el parto. Para el rebaño 7 el efecto de la dificultad al parto es diferente al rebaño 1, sólo es significativa la categoría fuertemente asistida. Los terneros de partos fuertemente asistidos tienen menor probabilidad de sobrevivir que aquellos sin asistencia. Respecto a los efectos a corto plazo (mortalidad), sólo encontramos predictores estadísticamente significativos en el rebaño 7 donde el riesgo de muerte de los nacidos de madres con una larga vida reproductiva, están al doble del riesgo de muerte que los nacidos de madres más jóvenes. Se incluye una discusión sobre las conclusiones erróneas que pueden obtenerse de los modelos estándar sino se toma en cuenta la cura.

 

Datos académicos de la tesis doctoral «Survival data analysis with heavy-censoring and long-term survivors«

  • Título de la tesis:  Survival data analysis with heavy-censoring and long-term survivors
  • Autor:  Lucas López Segovia
  • Universidad:  Politécnica de catalunya
  • Fecha de lectura de la tesis:  10/06/2014

 

Dirección y tribunal

  • Director de la tesis
    • Guadalupe Gómez Melis
  • Tribunal
    • Presidente del tribunal: pere Puig casado
    • montserrat Rue monne (vocal)
    • (vocal)
    • (vocal)

 

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