Development of molecular monitoring methods and assessment of the environmental fate of the biological control agent of fire blight pseudomonas fluorescens eps62e

Tesis doctoral de Marta Pujol Abajo

Erwinia amylovora es una bacteria fitopatógena que causa importantes pérdidas económicas en la producción de pera y manzana a nivel mundial. Tradicionalmente, el control del fuego bacteriano se ha realizado mediante productos químicos, formulados mayoritariamente con compuestos de cobre o antibióticos dependiendo de la legislación en cada país. No obstante, el uso reiterado de plaguicidas químicos ha causado efectos indeseables como la aparición de cepas resistentes y la presencia de residuos en los alimentos y el medio ambiente. Por este motivo, se han desarrollado métodos alternativos de control como el control biológico. En el grupo de patología vegetal de la universidad de girona se seleccionó y se está desarrollando el agente de control biológico del fuego bacteriano pseudomonas fluorescens eps62e por su alta eficacia en el control de infecciones causadas por e. Amylovora en frutos inmaduros, flores y plantas de peral. con el objetivo de contribuir al desarrollo del agente de biocontrol p. Fluorescens eps62e, en este trabajo se diseñó un método de trazabilidad molecular basado en la pcr a tiempo real y se evaluó la colonización y supervivencia de la cepa eps62e después de su inoculación en manzanos y perales en campo. el desarrollo de un método de pcr a tiempo real implicó (i) la detección de polimorfismos en el genoma de eps62e, (ii) la selección de fragmentos de amplificación que discriminasen eps62e frente a otras cepas para el diseño de cebadores scar (sequence characterised amplified regions), (iii) la evaluación de la especificidad de los cebadores scar, y (iv) el diseño de una pcr a tiempo real en una región interna de la secuencia scar. Para la detección de secuencias específicas presentes de manera natural en el genoma de eps62e se utilizaron dos métodos basados en la pcr que no requieren un conocimiento previo del genoma, la amplificación múltiple arbitraria (rapd) y la pcr inespecífica (u-pcr). Mediante ambas

 

Datos académicos de la tesis doctoral «Development of molecular monitoring methods and assessment of the environmental fate of the biological control agent of fire blight pseudomonas fluorescens eps62e«

  • Título de la tesis:  Development of molecular monitoring methods and assessment of the environmental fate of the biological control agent of fire blight pseudomonas fluorescens eps62e
  • Autor:  Marta Pujol Abajo
  • Universidad:  Girona
  • Fecha de lectura de la tesis:  19/12/2006

 

Dirección y tribunal

  • Director de la tesis
    • Emilio Montesinos Segui
  • Tribunal
    • Presidente del tribunal: Carlos Abella ametller
    • nuria Gaju ricart (vocal)
    • María milagros López gonzález (vocal)
    • haissam Jijakli (vocal)

 

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