Herramientas de cribado virtual aplicadas a inhibidores de tirosina quinasas. contribución al desarrollo del programa pralins para el diseño de quimiotecas combinatorias

Tesis doctoral de María Obdulia Rabal Gracia

La aplicación de métodos de cribado virtual cobra cada vez más importancia en el proceso de descubrimientos de fármacos, complementados a las técnicas de high-throughput screening con el fin de facilitar y contribuir a la comprensión de los mecanismos bioquímicos de actuación de los fármacos, agilizar y reducir el coste del proceso. en particular, el interés farmacológico de la presente tesis es la inhibición de receptores de tirosina quinasas. Estos enzimas participan en múltiples procesos de señalización celular, por lo que tanto la disfunción de las mismas o su papel privilegiado en los mecanismos del ciclo celular las convierten en diana farmacológica de enfermedades como el cáncer y otras relacionadas con desórdenes hiperproliferativos, migratorios, del desarrollo embrionario y enfermedades vasculares. Una de las estrategias de inhibición más usuales es el bloqueo del sitio de unión del atp a través de moléculas orgánicas como las piridopirimidinas, heterociclos especialmente interesantes para el grupo de investigación en el que se desarrolla este trabajo por su amplia experiencia sintética en dichos sistemas. en la presente tesis se exploran y validan gran parte de las técnicas de cribado virtual con el objetivo de establecer una secuencia jerarquizada de filtros que permitan evaluar aquellos compuestos candidatos a ser sinterizados. Los sucesivos pasos de filtrado incluyen la selección de compuestos de una quimioteca virtual a partir de la diversidad o representatividad del espacio químico, la aplicación de búsquedas de similitud y modelos farmacofóricos construidos a partir de inhibidores conocidos, un filtrado mediante docking o acoplamiento de los inhibidores en la cavidad de unión de estas proteínas y métodos de predicción de la afinidad de unión de una serie de ligandos. La jerarquía de estas etapas se impone a partir de la diferencia de recursos computacionales que requiere cada una de ellas, siendo éstos cada v

 

Datos académicos de la tesis doctoral «Herramientas de cribado virtual aplicadas a inhibidores de tirosina quinasas. contribución al desarrollo del programa pralins para el diseño de quimiotecas combinatorias«

  • Título de la tesis:  Herramientas de cribado virtual aplicadas a inhibidores de tirosina quinasas. contribución al desarrollo del programa pralins para el diseño de quimiotecas combinatorias
  • Autor:  María Obdulia Rabal Gracia
  • Universidad:  Ramón llull
  • Fecha de lectura de la tesis:  20/12/2006

 

Dirección y tribunal

  • Director de la tesis
    • Jordi Teixidó Closa
  • Tribunal
    • Presidente del tribunal: José ignacio Borrell bilbao
    • rosalia Pascula ramón (vocal)
    • gisbert Schneider (vocal)
    • jordi Mestres lopez (vocal)

 

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