Tesis doctoral de Alonso Aguirre Valderrama
En esta tesis se hace un estudio computacional (incluyendo cálculos ab initio y dft) de varios tioazúcares representativos, con un átomo de azufre en el anillo de piranosa, y se analiza, mediante estudios de docking y dinámica molecular, su poder inhibitorio frente a la enzima alfa-l-fucosidasa. se ha diseñado una metodología propia para el análisis conformacional sistemático del anillo de seis átomos, habiéndose implementado nuevos algoritmos para la caracterización de las formas no ideales de dicho anillo y para la generación de las diferentes formas canónicas del mismo. además, se ha desarrollado, en java, un programa de libre acceso, denominado cal3jhh (http://www.Ugr.Es/local/gmdm/java/3jhh/cal3jhh), que automatiza el proceso de reconocimiento y el cálculo de las constantes de acoplamiento de hidrógenos vecinales 3jh,h, incluyendo el promedio según las poblaciones de boltzmann.
Datos académicos de la tesis doctoral «Estudio mecanocuántico, docking y dinámica molecular de tioazúcares como inhibidores de la proteína fucosidasa: algoritmos para el análisis conformacional y programa para el cálculo de constantes de acoplamiento vecinales (cal3jhh)«
- Título de la tesis: Estudio mecanocuántico, docking y dinámica molecular de tioazúcares como inhibidores de la proteína fucosidasa: algoritmos para el análisis conformacional y programa para el cálculo de constantes de acoplamiento vecinales (cal3jhh)
- Autor: Alonso Aguirre Valderrama
- Universidad: Granada
- Fecha de lectura de la tesis: 29/09/2009
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- José Antonio Dobado Jiménez
- Tribunal
- Presidente del tribunal: Juan Antonio Lopez sastre
- alfonso Hernández laguna (vocal)
- Francisco Muñoz izquierdo (vocal)
- ibón Alkorta osoro (vocal)