Tesis doctoral de Ignacio Fernández Galván
En las últimas décadas, la química computacional se ha convertido en una herramientas muy importante para el estudio de las propiedades de la materia. Los sistemas en fase condensada – especialmente en fase líquida – presentan, sin embargo, una serie de propiedades que hacen necesario ele desarrollo de métodos específicos, y la introducción de aproximaciones adicionales a las normalmente empleadas para los sistemas en fase gaseosa. Esta tesis se centra en uno de estos métodos, denominado asep/md (averaged solvent electrostatic potential from molecular dynamics) y desarrollado por nuestro grupo de investigación. el método asep/md ha sido ampliado para permitir la optimización de estructuras moleculares en disolución, para lo cual es necesario disponer delas derivadas de la energía libre con respecto a las coordenadas nucleares. Como trabajo complementario, se ha puesto a punto un método para el cálculo de diferencias de energía libre y se ha verificado cuantitativamente la validez de la aproximación del campo medio, empleada por nuestro método. Asimismo, se ha elaborado un programa informático que facilita la puesta en práctica del desarrollo teórico. se han realizado también algunas aplicaciones prácticas a sistemas de interés. La validez de la aproximación del campo medio se ha comprobado con sistemas sencillos como alcoholes en estado líquido y disoluciones acuosas de compuestos carboncillos. El buen funcionamiento del método de optimización de geometría se ha verificado también con moléculas sencillas como el agua, el metanol o la formamida. Se ha efectuado un estudio más detallado sobre el equilibrio anomérico de un monosacárido, la d-xilopiranosa, y sobre una reacción sn2, la reacción de menshutkin entre el nh3 y el ch3cl. Finalmente se ha estudiado la dinámica de la isomerización del triazeno (n3h3) en agua mediante una aplicación combinada del método asep/md y de un método qm/mm tradicional.
Datos académicos de la tesis doctoral «Cálculo de las derivadas de la energia libre en disolución empleando un método quantum mechanics/molecular mechanics (qm/mm) y la aproximación del campo medio«
- Título de la tesis: Cálculo de las derivadas de la energia libre en disolución empleando un método quantum mechanics/molecular mechanics (qm/mm) y la aproximación del campo medio
- Autor: Ignacio Fernández Galván
- Universidad: Extremadura
- Fecha de lectura de la tesis: 21/12/2004
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Manuel Angel Aguilar Espinosa
- Tribunal
- Presidente del tribunal: manuel Yáñez montero
- Tuñón García de vicuña ignacio nilo (vocal)
- roberto Cammi (vocal)
- Villí i freixa jordi (vocal)