Tesis doctoral de Marcela Daniela Mena
La retinosis pigmentaria agrupa un conjunto de patologías con una asombrosa heterogeneidad genética y clínica que están caracterizadas por la disfunción progresiva de los fotorreceptores y posteriormente por la de otras capas de la retina. La pérdida visual consecuente, se manifiesta como ceguera nocturna, pérdida del campo visual periférico y en estadios avanzados de la enfermedad se ve afectada la visión central. La heterogeneidad genética que presenta la rp hace muy difícil el estudio de las bases moleculares implicadas en el desarrollo de la enfermedad en cada una de las familias afectadas. En la actualidad, ninguno de los genes descritos por si sólo es responsable de más del 5% de los casos de rp, exceptuando el locus rp25 que es responsable de la enfermedad en el 27 % de las familias rpar (barragan y cols., 2008). mediante el empleo de la estrategia mapeo de homocigosis combinado con análisis indirecto de genes candidatos, nuestro grupo identifico el locus rp25 en el brazo largo del cromosoma 6 en una región de 16.1cm entre los marcadores d6s257 y d6s1644. Con el objeto de identificar el gen responsable del locus rp25, nuestro grupo ha analizado y excluido el 55% de los genes dentro del intervalo rp25, como responsables del fenotipo rp. En el análisis de algunos de estos genes se identificaron snps en heterocigosis en bloques de homocigosidad. En el contexto de estos resultados, se realizaron estudios de cgh en microarray para evaluar la existencia de cnvs., Mediante estos resultados se identificaron dos grandes deleciones en la región pericentromerica del cromosoma 6q12. el objeto de estudio de la presente tesis doctoral, es la validación y refinamiento de los cnvs identificados mediante cgh array, además de la identificación de nuevos cnvs en nuestra cohorte de familias rpar. nuestro grupo ha publicado numerosos trabajos dedicados a identificar los genes presentes en dicho locus, finalmente identificamos el gen eys que codifica para la proteína spam humana y se encuentra en la posición 6q12 de dicha región, como el responsable de la rpar ligada al locus rp25 (abd el-aziz y cols, 2008). el presente trabajo está centrado en la caracterización genético-molecular de pacientes con rpar. Para ello, se seleccionaron 102 pacientes con retinosis pigmentaria autosómica recesiva pertenecientes a diferentes familias, de los cuales 11 estaban ligados al locus genético rp25 en trabajos previos (ruiz y cols., 1998, barragán y cols, 2008 ). con el objeto de confirmar, las cnvs detectadas previamente se ha diseñado, optimizado y validado una estrategia experimental para el análisis molecular y la caracterización de anomalías genéticas por variaciones en el número de copias en los exones del gen eys. El diseño elegido no sólo permite definir y confirmar los resultados previos obtenidos por nuestro grupo de trabajo, sino que además, sienta las bases para el diseño de estrategias similares aplicables a otras patologías de base genética. en general, las técnicas específicas de detección de cnvs basadas en microarrays no permiten detallar las características de las variaciones encontradas, aunque permiten hacer un sondeo de todo el genoma en simultáneo; por el contrario, la estrategia optimizada en esta tesis doctoral permite definir con alta precisión las características de estas variaciones y ha sido diseñada específicamente para estudiar cnvs en el gen eys.
Datos académicos de la tesis doctoral «Análisis molecular y validación de los resultados en la identificación y caracterización del gen responsable del locus rp25 mediante mlpa«
- Título de la tesis: Análisis molecular y validación de los resultados en la identificación y caracterización del gen responsable del locus rp25 mediante mlpa
- Autor: Marcela Daniela Mena
- Universidad: Sevilla
- Fecha de lectura de la tesis: 20/01/2010
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Guillermo Antiñolo Gil
- Tribunal
- Presidente del tribunal: Antonio gonzalo Castellano orozco
- salud Borrego lopez (vocal)
- Alberto Pascual bravo (vocal)
- Carlos Ruiz lapuente (vocal)