Caracterización fenotípica y molecular de hongos filamentosos oportunistas: scedosporium, acremonium, phialemonium, lecythophora y paecilomyces

Tesis doctoral de Haybrig Mercedes Perdomo Ziems

En los últimos años se ha reportado un importante aumento de las infecciones causadas por hongos filamentosos. Aunque la mayoría de dichas infecciones son producidas por especies de los géneros aspergillus y fusarium, se ha observado un incremento de la incidencia de micosis causadas por otros géneros menos conocidos, tales como scedosporium, acremonium, phialemonium, lecythophora y paecilomyces. En la presente tesis se han escogido los últimos cinco géneros debido a los escasos estudios existentes, la ausencia de datos epidemiológicos y taxonómicos, lo cual redunda en la elevada mortalidad asociada a estos hongos. En el caso de scedosporium, el género más conocido, el estudio se enfocó en la elección de la mejor herramienta para la tipificación de dos de sus especies: s. Aurantiacum y s. Prolificans. Mientras que, para los géneros anamórficos acremonium, phialemonium, lecythophora y paecilomyces, los estudios fueron orientados en la identificación morfológica y molecular de aislados, mayoritariamente clínicos, para establecer el espectro de especies y sus relaciones filogenéticos, y detectar posibles nuevas especies para su posterior caracterización. Para ello, se estudiaron 285 cepas, de estas 231 correspondían a aislados clínicos o ambientales y 54 eran cepas tipos y/o referencia procedentes de diversas colecciones internacionales. Los resultados de nuestro estudio sobre diferentes métodos para la tipificación molecular de s. Prolificans y s. Aurantiacum han indicado que, el sistema basado en la secuenciación multilocus (mlst) se presenta como la mejor metodología para la tipificación de estas especies. Hemos contribuido en la selección los genes que integraran el panel final que definirá el sistema mlst de s. Aurantiacum, mientras que para s. Prolificans es necesario la búsqueda de más genes informativos. La correlación de los resultados obtenidos mediante técnicas morfológicas y moleculares nos ha permitido establecer el espectro de las especies asociadas a muestras clínicas procedentes de diferentes hospitales de los estados unidos, siendo acremonium kiliense, cepas del complejo acremonium sclerotigenum-acremonium egyptiacum, acremonium implicatum, acremonium persicinum, acremonium atrogriseum, phialemonium obovatum, phialemonium curvatum, lecythophora hoffmannii, cephalotheca foveolata y lecythophora mutabilis las especies de más encontradas. Asimismo, se ha podido comprobar que los géneros acremonium y phialemonium son polifiléticos. Además, nuestros resultados nos han permitido realizar los siguientes planteamientos taxonómicos: – proponer el nuevo género phialemoniopsis. – transferir sarcopodium oculorum y phialemonium curvatum al género phialemoniopsis, y acremonium atrogriseum y taifanglania inflata al género phialemonium. – proponer las siguientes nuevas especies: phialemoniopsis cornearis, phialemoniopsis pluriloculosa, phialemonium globosum, lecythophora luteo-rubra, lecythophora cateniformis y paecilomyces lavendulus.

 

Datos académicos de la tesis doctoral «Caracterización fenotípica y molecular de hongos filamentosos oportunistas: scedosporium, acremonium, phialemonium, lecythophora y paecilomyces«

  • Título de la tesis:  Caracterización fenotípica y molecular de hongos filamentosos oportunistas: scedosporium, acremonium, phialemonium, lecythophora y paecilomyces
  • Autor:  Haybrig Mercedes Perdomo Ziems
  • Universidad:  Rovira i virgili
  • Fecha de lectura de la tesis:  20/10/2011

 

Dirección y tribunal

  • Director de la tesis
    • Josep Guarro Artigas
  • Tribunal
    • Presidente del tribunal: Francisco javier Cabañes saenz
    • dania García sánchez (vocal)
    • José Manuel Guillamón navarro (vocal)
    • gemma Castellí  gómez (vocal)

 

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