Towards the characterization of the eukaryotic selenoproteome: a computational approach

Tesis doctoral de Sergi Castellano Hereza

Las selenoproteínas incorporan el aminoácido selenocisteina (sec), un análogo de la cisteina (cys) que contiene se en lugar de s, en el proceso de traducción. este aminoácido esta codificado por el docon uga, normalmente utilizado como codon de terminación, lo que impide que los programas de predicción de genes identifiquen correctamente estas proteínas. por este motivo, hemos desarrollado programas específicos para la predicción de genes de selenoproteinas en genomas eucariotas. Estos programas se han utilizado para identificar nuevas familias de estos genes en diversos organismos humanos, drosophila, takifugu i tetraodon. el resultado de estos estudios son 9 familias nuevas de selenoproteinas. la anotación correcta de estos genes, nos ha permitido empezar a conocer la distribución de estos genes y de sus homólogos con cisteina en el linaje eucariota. Hemos observado una distribución en mosaico de los genes con se o s, lo que podría indicar la existencia de un proceso muy dinámico de intercambio entre sec y cys en la evolución de estos genes.

 

Datos académicos de la tesis doctoral «Towards the characterization of the eukaryotic selenoproteome: a computational approach«

  • Título de la tesis:  Towards the characterization of the eukaryotic selenoproteome: a computational approach
  • Autor:  Sergi Castellano Hereza
  • Universidad:  Pompeu fabra
  • Fecha de lectura de la tesis:  23/07/2004

 

Dirección y tribunal

  • Director de la tesis
    • Roderic Guigó Serra
  • Tribunal
    • Presidente del tribunal: alfonso Valencia herrera
    • daniel Gautheret (vocal)
    • ewan Birney (vocal)
    • herbert Jí¤ckle (vocal)

 

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