Tesis doctoral de David Vidal Montull
El descubrimiento y desarrollo de fármacos es un proceso interdisciplinario y costoso, tanto en términos económicos como temporales, en el cual las compañías farmacéuticas pueden invertir, de media, 880 millones de dólares y 15 años en investigación, hasta que un fármaco consigue entrar en el mercado. en este contexto, las metodologías computacionales pueden ofrecer algunas ventajas significativa disminuyendo en 130 millones de dólares y 0,8 años de media, el coste del proceso de descubrimiento y desarrollo de fármacos. Los métodos lingo son metodologías de análisis computacional altamente eficientes basadas en el análisis de los códigos smiles, una representación molecular textual altamente comprimida, que basada en el uso de mucha información implícita contienen la misma información que cualquier otra representación basada en una tabla de conectividad. Los métodos lingo, están basados en un protocolo de fragmentación de los códigos smiles, que ha permitido el desarrollo de un método de análisis de la similitud intermolecular, lingosim, que permite realizar 75.000 comparaciones por segundo. de la misma manera, los métodos lingo han permitido el generación de modelos qsrp, denominados lingo-qspr, para la predicción de propiedades moleculares, como logp, logs o la psa, que permite el procesado de más de 120.000 moléculas por segundo. La exactitud de estos modelos es comparable a la de los mejores métodos existentes en la actualidad, pero su velocidad de cálculo los supera, en muchos casos, en más de dos órdenes de magnitud. Por otra parte, se ha desarrollado un protocolo automatizado para el uso práctico del programa de docking autodock 3.0. Este protocolo incluye gran variedad de programas, tanto desarrollados en nuestro grupo como comerciales, que se encargan de llevar acabo de manera automatizada todas las tareas necesarias, generación de la estructura 3d de los ligandos, realización de los cálculos y análisi
Datos académicos de la tesis doctoral «Eines computacionals basades en lingo per al disseny molecular i la predicció de propietats«
- Título de la tesis: Eines computacionals basades en lingo per al disseny molecular i la predicció de propietats
- Autor: David Vidal Montull
- Universidad: Barcelona
- Fecha de lectura de la tesis: 14/07/2006
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Miquel Pons Vallés
- Tribunal
- Presidente del tribunal: ernest Giralt lledo
- victor m. Segarra matamoros (vocal)
- federico Gago badenas (vocal)
- jordi Mestres lopez (vocal)