Tesis doctoral de Julio Varea Ezquerro
Las enzimas líticas de neumococo y sus bacteriófagos, responsables de la degradación de la pared bacteriana, presentan una organización modular, con un módulo catalítico y otro de anclaje al sustrato formado, generalmente, por 6 repeticiones de 20 aminoácidos (motivos p1 a p6) y una extensión c-terminal de 18 residuos, que reconoce los restos de colina de la pared celular. En esta tesis se han abordado dos objetivos: i) implicaciones de la región terminal del módulo de unión a colina de la amidasa lyta de neumococo (motivos p5,p6 y 18 residuos terminales) en la organización estructural de la proteína y en el reconocimiento de colina y ii) implicaciones estructurales y funcionales de las diferencias en secuencia entre las amidasas de pared de neumococo codificadas por la bacteria y por sus bacteriófagos. Para ello se ha procedido a estudiar cuatro mutantes de lyta obtenidos por truncamiento de la región c-terminal (amidasas p6, p5, p4 y p5c) y 4 amidasas homólogas a lyta, (lyta101, pa1, ej1 y hb1), codificadas por el neumococo atípico 101/87 y los fagos dp-1, ej-1 y hb-3, respectivamente, caracterizando, en todos los casos, las diferencias en estructura secundaria, terciaria y cuaternaria, y en los equilibrios de unión a colina, producidas por la modificación de la estructura primaria. las técnicas empleadas han sido dicroísmo circular, espectroscopía infrarroja con transdormada de fourier, calorimetría diferencial de barrido y ultracentrifugación analítica. a nivel de su estructura secundaria, todas las proteínas estudiadas son de tipo mixto y presentan un elevado contenido en hojas y giros beta, siendo pequeñas las diferencias existentes respecto a la amidasa lyta. todas las mureín-hidrolasas caracterizadas hasta el momento presentan equilibrios de autoasociación regulados por la unión de colina. Los resultados obtenidos para los diferentes mutantes truncados de lyta han permitido demostrar
Datos académicos de la tesis doctoral «Caracterizacion estructural y termodinamica de las amidasas de s. pneumoniae y de los bacteriofagos dp-1, ej-1 y hb-3.«
- Título de la tesis: Caracterizacion estructural y termodinamica de las amidasas de s. pneumoniae y de los bacteriofagos dp-1, ej-1 y hb-3.
- Autor: Julio Varea Ezquerro
- Universidad: Autónoma de Madrid
- Fecha de lectura de la tesis: 01/01/1999
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Margarita Menendez Fernandez
- Tribunal
- Presidente del tribunal: Juan pedro García ballesta
- Laynez vallejo José Luis (vocal)
- Francisco García blanco (vocal)
- José Luis Garcia lopez (vocal)