Cristalizacion y estudios estructurales de oligonucleotidos: el octamero d(pcpcpcpgpcpgpgpg)2 y el dodecamero d(cpgpcpcpcpgpcpgpgpgpcpg)2.

Tesis doctoral de Luzimar Gonzaga Fernandez

El dna es flexible, puede curvarse, deformarse, y presentar conformaciones transicionales. Básicamente, la forma del dna depende de dos factores: la secuencia de bases y las condiciones de su entorno. Con este trabajo se ha pretendido aportar nuevos datos sobre dos cuestiones planteadas a nivel de análisis estructural del dna por cristalografía de rayos x: 1) la influencia de la secuencia del dna, y 2) las condiciones de cristalización en la propia conformación de la molécula. el presente trabajo de tesis se ha centrado en la cristalización y en el estudio estructural mediante la técnica de difracción de rayos x de dos oligonucleótidos: el octámero d(pcpcpcpgpcpgpgpg)2 y el dodecámero d(cpgpcpcpcpgpcpgpgpgpcpg)2, con el objetivo de evaluar el efecto de la secuencia de bases, del empaquetamiento y del entorno en la conformación del dna. Las secuencias de dna estudiadas son ricas en cg. La determinación de estas estructuras contribuirá a un conocimiento más preciso del a-dna: influencia de la secuencia, de las condiciones del entorno del dna y la naturaleza de la interacción entre dna y otras moléculas. Todo ello es básico para la comprensión de los fenómenos en los cuales el dna está implicado. en primer lugar se ha efectuado un análisis de las diferentes condiciones que pueden ser utilizadas sistemáticamente para cristalizar una misma secuencia de bases en diferentes sistemas cristalinos. En segundo lugar se hizo un estudio de la influencia de la concentración de contra-iones en la cristalización y conformación de un mismo fragmento de dna. Paralelamente se ha realizado un estudio de las condiciones de cristalización en presencia de la proteína 0. Todos los estudios de cristalización se han abordado de forma sistemática, probando diferentes precipitantes, diversos contraiones y diferentes condiciones de ph, a fin de evaluar la influencia de todos esos factores en el crecimiento de cristales d

 

Datos académicos de la tesis doctoral «Cristalizacion y estudios estructurales de oligonucleotidos: el octamero d(pcpcpcpgpcpgpgpg)2 y el dodecamero d(cpgpcpcpcpgpcpgpgpgpcpg)2.«

  • Título de la tesis:  Cristalizacion y estudios estructurales de oligonucleotidos: el octamero d(pcpcpcpgpcpgpgpg)2 y el dodecamero d(cpgpcpcpcpgpcpgpgpgpcpg)2.
  • Autor:  Luzimar Gonzaga Fernandez
  • Universidad:  Politécnica de catalunya
  • Fecha de lectura de la tesis:  01/01/1998

 

Dirección y tribunal

  • Director de la tesis
    • Juan Antonio Subirana Torrent
  • Tribunal
    • Presidente del tribunal: Luis Puijaner Corbella
    • Valya Tereshko (vocal)
    • Xavier Solans Huguet (vocal)
    • Anna Grandas Sagarra (vocal)

 

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