Tesis doctoral de Raquel Tobes Terán
Se han diseñado un conjunto de algoritmos basados en autómatas deterministas finitos especialmente orientados a secuencias biológicas: 1- autómata para búsqueda de patrones exactos 2- autómata traductor: traduce todas las «reading-frames» pasando cada letra de la secuencia una sola vez por el autómata. 3- autómata para comprimir textos 4- autómata contador: cuenta todas las k-tuplas solapantes. 5- autómatas busca-palabras compartidas: especialmente orientados a la búsqueda de similitudes locales dispersas independiente de alineamiento. todas estas herramientas son especialmente útiles estudiando secuencias biológicas para buscar patrones nuevos con significado funcional, para caracterizar grupos de secuencias y para buscar similitudes locales dispersas que pueden estar en la base de fenómenos de evolución convergente, mimetismo molecular y fenómenos autoinmunes. se han aplicado las máquinas busca-palabras compartidas para detectar una relación entre la app(proteína precursora de amiloide) y el bdnf (factor de crecimiento nervioso) que podría tener importantes repercusiones.
Datos académicos de la tesis doctoral «Diseño de un nuevo algoritmo para búsqueda de patrones en secuencias biológicas«
- Título de la tesis: Diseño de un nuevo algoritmo para búsqueda de patrones en secuencias biológicas
- Autor: Raquel Tobes Terán
- Universidad: Granada
- Fecha de lectura de la tesis: 04/10/2000
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Eduardo Pareja Tallo
- Tribunal
- Presidente del tribunal: obdulio López mayorga
- joaquín Dopazo blázquez (vocal)
- Rodriguez salas Antonio Jesús (vocal)
- Juan Luis Ramos martin (vocal)