Tesis doctoral de álvaro Mateos Gil
En esta tesis de título «estudio y aplicación de métodos supervisados para el análisis de patrones de expresión génica» se ha realizado un estudio sobre la aplicación de métodos de aprendizaje supervisado para el análisis de datos de expresión génica a escala genómica. los patrones de expresión génica se obtienen mediante la técnica de los microarrays y consisten en los valores de expresión de la mayor parte, o todos, los genes de un genoma, a nivel de la transcripción. los métodos de aprendizaje supervisado son una serie de técnicas del campo del aprendizaje estadístico e inteligencia artificial. Mediante este tipo de métodos se pueden clasificar conjuntos de datos multivariante. La característica que define a estos métodos es que utilizan información definida de manera independiente a los propios datos, por ello el nombre de «supervisados». típicamente, dicha información puede ser la pertenencia a diversas clases de los diferentes elementos presentes en el conjunto de datos. Mediante un proceso de aprendizaje a partir de ejemplos cuya clase es conocida, este tipo de métodos ajustan funciones de decisión que pueden ser utilizadas para la clasificación de elementos de clase desconocida. en esta tesis se han estudiado los métodos de aprendizaje supervisados perceptrón y perceptrón multicapa (dos conocidos tipos de red neuronal) y las máquinas de vectores de soporte (svm). Cuando fue necesario se combinaron el perceptrón y las svm con un método no supervisado de clustering llamado sota, para reducir la dimensionalidad de los datos originales. aplicando los métodos supervisados mencionados a conjuntos de datos de expresión génica, se ha llevado a cabo un estudio de predicción de función en genes de la levadura saccharomyces cerevisiae. También se han aplicado a la predicción de clase fenotípica de muestras tumorales y sanas. por último, se ha utilizado un método de bi-clustering supervisa
Datos académicos de la tesis doctoral «Estudio y aplicación de métodos supervisados para el análisis de patrones de expresión génica«
- Título de la tesis: Estudio y aplicación de métodos supervisados para el análisis de patrones de expresión génica
- Autor: álvaro Mateos Gil
- Universidad: Autónoma de Madrid
- Fecha de lectura de la tesis: 14/03/2006
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Joaquin Dopazo Blázquez
- Tribunal
- Presidente del tribunal: ricardo Amils pibernat
- Ana Dopazo (vocal)
- Juan cruz Cigudosa garcia (vocal)
- Pérez ortín José enrique (vocal)