Tesis doctoral de Oswaldo Trelles Salazar
Este trabajo se centra en la comparacion de secuencias biologicas de dna o de proteina, y en los aportes que desde la computacion de alto rendimiento hacemos para resolver problemas en las siguientes areas: matrices de puntos (dotplots): reformulacion de su analisis desde la perspectiva del procesamiento digital de imagenes, abriendo un conjunto nuevo de posibilidades en el area.Busquedas en bases de datos: desarrollo de una estrategia generica para la paralelizacion de los algoritmos de busqueda, con especial interes en los problemas de distribucion y balanceo del gran volumen de datos de las secuencias biologicas. La estrategia se ha mostrado portable a lo largo de diversas arquitecturas que van desde los cluster de estaciones de trabajo hasta los grandes supercomputadores. significancia estadistica: desarrollo de una propuesta eficiente para reproducir las distribuciones de semejanzas desde las cuales se evalua la significancia. el algoritmo se ajusta perfectamente a las estrategias de paralelizacion desarrolladas. alineamientos multiples: propuesta para reducir el enorme espacio computacional de este tipo de trabajos, con resultados plenamente satisfactorios y una implementacion en paralelo.
Datos académicos de la tesis doctoral «Paralelizacion de algoritmos de comparacion de secuencias biologicas en grandes bases de datos.«
- Título de la tesis: Paralelizacion de algoritmos de comparacion de secuencias biologicas en grandes bases de datos.
- Autor: Oswaldo Trelles Salazar
- Universidad: Málaga
- Fecha de lectura de la tesis: 01/01/1996
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- José María Carazo Garcia
- Tribunal
- Presidente del tribunal: Jose Mira Mira
- Francisco Tirado Fernández (vocal)
- Francisca María Sanchez Jimenez (vocal)
- Alfonso Valencia (vocal)