Análisis de la estructura del transportador adp/atp por espectroscopia de infrarrojo utilizando métodos matemáticos de estrechamiento y ajuste de bandas

Tesis doctoral de Victor Armando Lorenz Fonfría

El transportador adp/atp (anc2) es una proteína de membrana localizada en la membrana interna mitocondrial, y cuya funicón fisiológica es el intercambio del atp mitocondrial por adp citosólico. Se estudió el transportador adp/atp de la levadura s.Cerevisiae (anc2) inhibiendo con carboxiatractilósido (anc2*c-atr), tanto solubilizado en el detergente docecilmaltósido como reconstituido en liposomas de fosfatidil colina/ácido fosfatídico. mediante el análisis de espectros de infrarrojo de proteínas, obtenidos sin radiación polarizada y con radiación polarizada, se puede obtener información sobre su estructura, orientación. Los espectros obtenidos en presencia de d2o permiten determinar la accesibilidad al disolvente. Estos análisis requieren , entre otros, la aplicación de métodos de estrechamiento y de ajuste de bandas, especialmente necesarios para la obtención de información estructural. Se revisaron y ampliaron tres métodos de estrechamiento de bandas basados en la desconvolución: la desconvolución de fourier, la desconvolución regularizada (lineal y por máxima entropía) y la desconvolución de fourier combinada con predicción lineal. Asimismo se caracterizó el ejuste de bandas desconvuladas por fourier. el estudio del anc2*c-atr en su forma reconstituida reveló un 40% de hélices, 15% de láminas beta, 30% de giros y 15% de estructuras irregulares. El 40% de hélices es coherente en seis hélices transmembrana. la orientación de éstas hélices respecto a la normal de la membrana se determinó en 34-40ºc. El nivel de intercambio hidrógeno/deuterio obtenido fue comparable con el publicado para otros transportadores de moléculas hidrofóbicas, y bastante superior al de los canales.

 

Datos académicos de la tesis doctoral «Análisis de la estructura del transportador adp/atp por espectroscopia de infrarrojo utilizando métodos matemáticos de estrechamiento y ajuste de bandas«

  • Título de la tesis:  Análisis de la estructura del transportador adp/atp por espectroscopia de infrarrojo utilizando métodos matemáticos de estrechamiento y ajuste de bandas
  • Autor:  Victor Armando Lorenz Fonfría
  • Universidad:  Autónoma de barcelona
  • Fecha de lectura de la tesis:  21/07/2003

 

Dirección y tribunal

  • Director de la tesis
    • Esteve Padrós Morell
  • Tribunal
    • Presidente del tribunal: ramon Dabán joan
    • ocatvi Viñas (vocal)
    • Rodríguez arrondo José Luis (vocal)
    • romí  Tauler ferré (vocal)

 

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