Tesis doctoral de Gonzalo Durante Rodriguez
Null los compuestos aromáticos, como los componentes de la lignina, los flavonoides, las quinonas, los aminoácidos aromáticos o los componentes de los combustibles fósiles, son los compuestos orgánicos más extendidos en la naturaleza después de los carboh idratos. Los microorganismos juegan un papel crucial en la degradación de estos compuestos mediante dos estrategias principales dependiendo de la presencia o ausencia de oxígeno. El catabolismo aeróbico de aromáticos ha sido ampliamente estudiado, al contrario de lo que sucede con el catabolismo anaeróbico, del cual se tiene mucha menos información. Así, en la actualidad se conocen pocos sistemas reguladores implicados en el catabolismo anaeróbico de compuestos aromáticos. Uno de estos sistemas es el responsable de la regulación del catabolismo anaeróbico del benzoato en la beta-proteobacteria azoarcus sp. Cib, cuyo mecanismo de regulación ha sido parcialmente caracterizado. Este sistema consta de dos operones, bzdr y bzdnopqmstuvwxyza, que codifican el represor bzdr y las enzimas implicadas en la degradación anaeróbica del benzoato, respectivamente, y se encuentran bajo el control del promotor pr y pn, respectivamente. por tanto, y con el fin de ampliar este conocimiento, en esta tesi s se propusieron una serie de objetivos dirigidos a profundizar tanto en el conocimiento del mecanismo molecular responsable de la regulación del catabolismo anaeróbico de benzoato en azoarcus sp. Cib, como en la caracterización estructural y modular de la proteína reguladora bzdr, responsable del control de la expresión del cluster bzd. en este sentido, se ha caracterizado la regulación dependiente de oxígeno del cluster bzd, pudiéndose comprobar que la proteína fnr* de e. Coli es necesaria en la activación del promotor pn. Además, se caracterizó la región operadora donde se une fnr* al promotor pn determinándose que es un activador de clase ii, así como las regiones de interacción de esta proteína con la arn-polimerasa. También se pudo id entificar un nuevo regulador, denominado acpr, en azoarcus sp. Cib, miembro de la proteína fnr, cuyo papel es activar el promotor pn en ausencia de oxígeno en el medio. En esta misma línea, se caracterizó la expresión del promotor pr del gen bzdr, el cual es regulado por su propio producto génico, el represor bzdr, mediante un sistema de feedback negativo. por otro lado, los estudios llevados a cabo con la proteína bzdr demostraron que posee una arquitectura modular constituida por dos dominios
Datos académicos de la tesis doctoral «Estudios moleculares del sistema regulador de la degradación anaeróbica de benzoato en azoarcus sp. cib.«
- Título de la tesis: Estudios moleculares del sistema regulador de la degradación anaeróbica de benzoato en azoarcus sp. cib.
- Autor: Gonzalo Durante Rodriguez
- Universidad: Complutense de Madrid
- Fecha de lectura de la tesis: 07/07/2009
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Eduardo Diaz Fernandez
- Tribunal
- Presidente del tribunal: tino Krell
- (vocal)
- (vocal)
- (vocal)