Development of high-performance algorithms for a new generation of versatile molecular descriptors. the pentacle software.

Tesis doctoral de ángel Durán Alcaide

El trabajo que se presenta en esta tesis se ha centrado en el desarrollo de algoritmos de altas prestaciones para la obtención de una nueva generación de descriptores moleculares, con numerosas ventajas con respecto a sus predecesores, adecuados para diversas aplicaciones en el área del diseño de fármacos, y en su implementación en un programa científico de calidad comercial (pentacle). inicialmente se desarrolló un nuevo algoritmo de discretización de campos de interacción molecular (amanda) que permite extraer eficientemente las regiones de máximo interés. Este algoritmo fue incorporado en una nueva generación de descriptores moleculares independientes del alineamiento, denominados grind-2. La rapidez y eficiencia del nuevo algoritmo permitieron aplicar estos descriptores en cribados virtuale. Por último, se puso a punto un nuevo algoritmo de codificación independiente de alineamiento (clacc) que permite obtener modelos cuantitativos de relación estructura-actividad con mejor capacidad predictiva y mucho más fáciles de interpretar que los obtenidos con otros métodos.

 

Datos académicos de la tesis doctoral «Development of high-performance algorithms for a new generation of versatile molecular descriptors. the pentacle software.«

  • Título de la tesis:  Development of high-performance algorithms for a new generation of versatile molecular descriptors. the pentacle software.
  • Autor:  ángel Durán Alcaide
  • Universidad:  Pompeu fabra
  • Fecha de lectura de la tesis:  04/03/2010

 

Dirección y tribunal

  • Director de la tesis
    • Manuel Pastor Maeso
  • Tribunal
    • Presidente del tribunal: gerhard f. Ecker
    • fabien Fontaine (vocal)
    • jordi Mestres lopez (vocal)
    • jordi Quintana ruíz (vocal)

 

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