Tesis doctoral de Daniel Gonzalez Ibeas
El melón es uno de los cultivos más importantes del mundo. Las infecciones por virus son una de las principales causas de pérdidas en la producción, mayoritariamente las causadas por virus de rna. El muestreo de los transcritos de rna (transcriptoma) que se generan a partir del genoma proporciona un abordaje funcional al contenido genético de una especie. En esta tesis se aporta un análisis de dos porciones del transcriptoma de melón: la que corresponde a transcritos que codifican proteínas mediante un microarray de dna, y la que corresponde a pequeños rnas no codificantes mediante secuenciación masiva. Se ha analizado el transcriptoma en respuesta a la infección por el virus del mosaico de la sandía en un genotipo de melón resistente y otro susceptible al virus. Además, se ha optimizado un método de síntesis de cdna para hibridaciones en microarray. Se ha optado por presentar la tesis en modo de compendio de tres publicaciones. palabras clave: melón, genotecas, cdna, microarray, pirosecuenciación, ests, pequeños rnas, virus, transcriptómica abstract. melon is one of the most important horticultural crops worldwide. Plant viral diseases cause serious economic losses by reducing yield and quality. Sampling of the complete set of cellular rna transcripts (transcriptome) has been used as an effective method for dissecting genetic content of many species and for analyzing several biological processes. In this thesis, two parts of the melon transcriptome have been analyzed: protein-coding transcripts by means of a dna microarray, and small rnas by means of pyrosequencing. Transcriptomic changes in response to watermelon mosaic virus infection have been monitored in a resistant and a susceptible melon genotype. In addition, a method for cdna synthesis for microarray hybridizations has been optimized. Results are presented as a compilation of three publications. key words: melon, cdna libraries, cdna, microarray, pyrosequencing, ests, small rnas, virus, transcriptomic
Datos académicos de la tesis doctoral «Muestreo y análisis del transcriptoma de melón (cucumis melo l.)«
- Título de la tesis: Muestreo y análisis del transcriptoma de melón (cucumis melo l.)
- Autor: Daniel Gonzalez Ibeas
- Universidad: Murcia
- Fecha de lectura de la tesis: 23/07/2012
Dirección y tribunal
- Director de la tesis
- Verónica Truniger Rietmann
- Tribunal
- Presidente del tribunal: victoriano Valpuesta fernandez
- María belen Pico sirvent (vocal)
- Francisco borja Flores pardo (vocal)
- Miguel angel Botella mesa (vocal)